Muzejs iekārtots vēsturiskā ēkā - bijušajā Vidzemes draudzes skolu skolotāju seminārā, kuru dibināja un vadīja Jānis Cimze. Tāpēc tieši Valkas novadpētniecības muzejā, apmeklētājiem pieejamā veidā tiek apkopotas visas vēsturiskās liecības par J.Cimzes un viņa audzēkņu daudzpusīgo kultūrizglītojošo darbību.